Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms