Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB2A8KAH6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms