Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf49A4QMS7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms