Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VWA8A3KMH1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VWA8A3KMH1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms