Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UTP11Q9Y3A2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms