Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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