Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYH13Q9UKX3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MYH13Q9UKX3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms