Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID2Q9UJV3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID2Q9UJV3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID2Q9UJV3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID2Q9UJV3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID2Q9UJV3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID2Q9UJV3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID2Q9UJV3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID2Q9UJV3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID2Q9UJV3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID2Q9UJV3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID2Q9UJV3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID2Q9UJV3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID2Q9UJV3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms