Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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