Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MBD5Q9P267 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms