Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms