Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERINC1Q9NRX5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms