Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BATF3Q9NR55 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms