Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms