Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BCAS3Q9H6U6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms