Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms