Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NYXQ9GZU5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NYXQ9GZU5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms