Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms