Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms