Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms