Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms