Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms