Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms