Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBBP8Q99708 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms