Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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