Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms