Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms