Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms