Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms