Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms