Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNF34Q969K3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF34Q969K3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms