Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCSTNQ92542 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms