Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113Q902F9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms