Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC21AQ8NDW8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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