Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms