Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms