Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms