Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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