Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PBRM1Q86U86 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PBRM1Q86U86 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PBRM1Q86U86 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PBRM1Q86U86 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PBRM1Q86U86 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PBRM1Q86U86 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PBRM1Q86U86 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PBRM1Q86U86 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PBRM1Q86U86 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PBRM1Q86U86 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PBRM1Q86U86 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PBRM1Q86U86 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PBRM1Q86U86 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PBRM1Q86U86 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PBRM1Q86U86 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms