Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms