Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms