Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms