Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms