Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRAIDQ6UW56 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms