Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC1Q6TDU7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC1Q6TDU7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms