Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms