Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms