Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms