Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27BQ5VT28 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27BQ5VT28 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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