Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms